医師が教えるR言語での医療データ分析入門 -発展編(集計)： 集計表と公的なデータから レポートを作ってみよう！

👩‍⚕️ 医師が教えるR言語での医療データ分析入門 - 発展編（集計）： 集計表と公的なデータからレポートを作ってみよう！

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はじめに

本コースでは、R言語を用いた医療データ分析の基本から、実践的なスキルまでを学びます。特に、以下の内容に焦点を当てています。

基本：

• テーブルワン（集計表）を作成する方法：
  • tidyverseの関数を利用した作成方法
  • arsenalを利用した作成方法
• これらの方法を通じて、論文などの最初の表としてよく使われるテーブルワンの作り方を学びます。

実践：

• 国立感染症研究所のオープンデータを分析に活用し、パワーポイント形式のレポート作成のスキルを身につけます。
• レポート内容をGUI（マウス操作）で簡単に変更できるようにするレポートの作成方法を学びます。

おまけ：

• 日本地図をggplot2で描画する方法を解説します。

コース内容の詳細

基本コースでは紹介されていなかった重要ポイントを学びます

• 集計データのグループ化：dplyrのsummarise関数を使った活用方法を学びます。この技術は、テーブルワンとしてよく利用されるので、研究や報告書作成に役立ちます。
• tidyverseの関数を利用した集計表作成方法を学び、その後、arsenalなどの表集計専用のパッケージを使った方法で比較体験します。これにより、目的に沿ったパッケージの選択の必要性を理解する機会を得ます。

実践編では、学んだ知識を実世界のデータ分析に応用します

• 国立感染症研究所が提供する、都道府県別、感染症別の定点当たり報告数というエクセルデータをダウンロードし、Rで分析に適した形式へ加工する方法を学びます。
• これを活用して、自分でGUI（マウス操作）でレポートの内容を選択・変更するレポートを作成する方法を学びます。これにより、Rの知識がなくても、レポート作成が簡単に行えるようになります。

特別追加：地図の描画

• ggplot2を使った日本地図の描写方法も解説します。データ分析の結果を視覚的に表現するスキルを身につけ、より理解しやすいレポートやプレゼンテーションを作成できます。

このコースを通じて、医療データ分析の基本から応用技術までを身につけ、R言語を使ったデータ分析とレポート作成の能力を高めることができるでしょう。実践的なスキルを得て、医療分野での意思決定をサポートするためのデータ分析師になる手助けをさせていただきます。